Рандомизированное машинное обучение и прогнозирование нелинейных динамических моделей c применением к эпидемиологической модели SIR
Ключевые слова:
рандомизированное машинное обучение, энтропия, энтропийное оценивание, прогнозирование, рандомизированное прогнозированиеАннотация
В работе предлагается подход к оцениванию параметров нелинейных динамических моделей с помощью концепции Рандомизированного машинного обучения (РМО), основанной на переходе от детерминированных моделей к случайным (со случайными параметрами) с последующим оцениванием вероятностных распределений параметров и шумов по реальным данным. Главной особенностью данного метода является его эффективность в условиях малого количества реальных данных. В работе рассматриваются модели, сформулированные в терминах обыкновенных дифференциальных уравнений, которые преобразуются к дискретному виду для постановки и решения задачи энтропийной оптимизации. Применение предлагаемого подхода демонстрируется на задаче прогнозирования общего количества инфицированных COVID-19 с помощью динамической
эпидемиологической модели SIR. Для этого в работе строится рандомизированная модель SIR (R-SIR) с одним параметром, энтропийно-оптимальная оценка которого реализуется его функцией плотности распределения вероятностей, а также функциями плотности распределения вероятностей измерительных шумов в точках, в которых производится обучения. Далее применяется техника рандомизированного прогнозирования с фильтрацией шумов, основанная на генерации соответствующих распределений и построении ансамбля прогнозных траекторий с вычислением средней по ансамблю траектории. В работе реализуется вычислительный эксперимент с использованием реальных оперативных данных о заболеваемости в виде сравнительного исследования с известным методом оценивания параметров модели, основанным на методе наименьших квадратов. Полученные в эксперименте результаты демонстрируют существенное снижение средне-абсолютной процентной ошибки (MAPE) при по отношению к реальным наблюдениям на интервале прогноза, что показывают работоспособность предложенного метода и его эффективность в задачах рассматриваемого в работе типа.
Литература
2. van den Driessche P. Mathematical Epidemiology / ed. by Brauer F., van den Driessche P., Wu J. Berlin, Heidelberg: Springer Berlin Heidelberg, 2008. Vol. 1945 of Lecture Notes in Mathematics. P. 147–157. https://doi.org/10.1007/978-3-540-78911-6.
3. Айвазян С.А., Мхитарян В.С. Прикладная статистика и основы эконометрики.— М.:Юнити, 1998.
4. Лагутин М.Б. Наглядная математическая статистика. — Бином. Лаб. знаний, 2013.
5. Боровков А.А. Математическая статистика. — М.:Наука, 1984.
6. Bishop C. Pattern Recognition and Machine Learning (Information Science and Statistics), 2006. Springer, New York, 2006.
7. Hastie T., Tibshirani R., Friedman J. The Elements of Statistical Learning: Data mining, Inference, and Prediction. Springer New York, 2009.
8. Мерков А.Б. Распознавание образов. Введение в методы статистического обучения. М. : URSS, 2010.
9. Попков Ю.С., Попков А.Ю., Дубнов Ю.А. Рандомизированное машинное обучение при ограниченных наборах данных: от эмпирической вероятности к энтропийной рандомизации. — М.: ЛЕНАНД, 2019. ISBN: 978-5-9710-5908-0.
10. Попков Ю.С., Дубнов Ю.А. Энтропийно-робастное рандомизированное прогнозирование при малых объемах ретроспективных данных // Автоматика и телемеханика. 2016. № 5. С. 109–127.
11. Попков А.Ю. Рандомизированное машинное обучение нелинейных моделей с применением к прогнозированию развития эпидемического процесса // Автоматика и телемеханика. 2021. № 6. С. 149–168. https://doi.org/10.31857/S0005231021060064.
12. Popkov Y.S., Dubnov Y.A., Popkov A.Y. Introduction to the Theory of Randomized Machine Learning // Learning Systems: From Theory to Practice / ed. by Sgurev V., Piuri V., Jotsov V. Cham: Springer International Publishing, 2018. P. 199–220. ISBN: 978-3-319-75181-8. https://doi.org/10.1007/978-3-319-75181-8_10.
13. Попков Ю.С., Попков А.Ю., Дубнов Ю.А. Элементы рандомизированного прогнозирования и его применение для предсказания суточной электрической нагрузки энергетической системы // Автоматика и телемеханика. 2020. С. 148–172. https://doi.org/10.1134/S0005231019070107.
14. Kermack W.O., McKendrick A.G. Contributions to the Mathematical Theory of Epidemics // Proceedings of the Royal Society. 1927. Vol. 115A. P. 700–721.
15. Muller G.R. Zeitschrift f¨ur allgemeine Mikrobiologie / In: The Population Dynamics of Infectious Diseases: Theory and Applications. 368 S., 135 Abb., 104 Tab. London-New York, Chapman and Hall, 1984, Vol. 24, no. 2. pp. 76–76. https://doi.org/10.1002/jobm.19840240203.
16. Hethcote H.W. Three Basic Epidemiological Models // Applied Mathematical Ecology. Springer Berlin Heidelberg, 1989. pp. 119–144. https://doi.org/10.1007/978-3-642-61317-3_5.
17. Peng L., Yang W., Zhang D., Zhuge C., Hong L. Epidemic analysis of COVID-19 in China by dynamical modeling // arXiv, 2020. 10.48550/ARXIV.2002.06563.
18. Yang W., Zhang D., Peng L., Zhuge C., Hong L. Rational evaluation of various epidemic models based on the COVID-19 data of China // Epidemics, 2021. Vol. 37. p. 100501. https://doi.org/10.1016/j.epidem.2021.100501.
19. Cheng C., Zhang D., Dang D., Geng J., Zhu P., Yuan M., Liang R., Yang H., Jin Y., Xie J., Chen S., Duan G. The incubation period of COVID-19: a global meta-analysis of 53 studies and a Chinese observation study of 11 545 patients // Infectious Diseases of Poverty, 2021. Vol. 10, no. 1. https://doi.org/10.1186/s40249-021-00901-9.
20. Huang S., Li J., Dai C., Tie Z., Xu J., Xiong X., Hao X., Wang Z., Lu C. Incubation period of coronavirus disease 2019: New implications for intervention and control // International Journal of Environmental Health Research, 2021. P. 1–9. https://doi.org/10. 1080/09603123.2021.1905781.
21. Li Q. et al. Early Transmission Dynamics in Wuhan, China, of Novel Coronavirus — Infected Pneumonia // New England Journal of Medicine, 2020. Vol. 382, no. 13. P. 1199–1207. https://doi.org/10.1056/nejmoa2001316.
22. Nie X. et al. Epidemiological Characteristics and Incubation Period of 7015 Confirmed Cases With Coronavirus Disease 2019 Outside Hubei Province in China // The Journal of Infectious Diseases, 2020. Vol. 222, no. 1. pp. 26–33. https://doi.org/10.1093/infdis/jiaa211.
23. Guidotti E., Ardia D. COVID-19 Data Hub // Journal of Open Source Software. 2020. Vol. 5, no. 51. P. 2376. https://doi.org/10.21105/joss.02376.
24. COVID-19 Data Hub. https://www.covid19datahub.io. 2021. Accessed: 2022-06-20.
25. Флах П. Наука и искусство построения алгоритмов, которые извлекают знания из данных. ДМК Пресс, 2015.
26. Rubinstein R.Y., Kroese D.P. Simulation and the Monte Carlo method. John Wiley & Sons, 2007. Vol. 707.
Randomized Machine Learning and Forecasting of Nonlinear Dynamic Models Applied to SIR Epidemiological Model
Abstract
We propose an approach to estimation of the parameters of non-linear dynamic models using the concept of Randomized Machine Learning (RML), based on the transition from deterministic models to random ones (with random parameters), followed by estimation of the probability distributions of parameters and noises on real data. The main feature of this method is its efficiency in conditions of a small amount of real data. The paper considers models formulated in terms of ordinary differential equations, which are converted to a discrete form for setting and solving the problem of entropy optimization. The application of the proposed approach is demonstrated on the problem of predicting the total number of infected COVID-19 using a
dynamic SIR epidemiological model. To do this, we construct a randomized SIR model (R-SIR) with one parameter, the entropy-optimal estimate of which is realized by its probability density function, as well as the probability density functions of the measurement noise at the points where training is performed. Next, the technique of randomized prediction with noise filtering is applied, based on the generation of the corresponding distributions and the construction of an ensemble of predictive trajectories with the calculation of the trajectory averaged over the ensemble. The paper implements a computational experiment using real operational data on the infection cases in the form of a comparative study with a well-known method for estimating model parameters based on the least squares method. The results obtained in the experiment demonstrate a significant decrease in the mean absolute percentage error (MAPE) with respect to real observations in the forecast interval, which shows the efficiency of the proposed method and its effectiveness in problems of the type considered in the work.
Опубликован
Как цитировать
Раздел
Copyright (c) Попков Алексей Юрьевич

Это произведение доступно по лицензии Creative Commons «Attribution» («Атрибуция») 4.0 Всемирная.
Авторы, которые публикуются в данном журнале, соглашаются со следующими условиями: Авторы сохраняют за собой авторские права на работу и передают журналу право первой публикации вместе с работой, одновременно лицензируя ее на условиях Creative Commons Attribution License, которая позволяет другим распространять данную работу с обязательным указанием авторства данной работы и ссылкой на оригинальную публикацию в этом журнале. Авторы сохраняют право заключать отдельные, дополнительные контрактные соглашения на неэксклюзивное распространение версии работы, опубликованной этим журналом (например, разместить ее в университетском хранилище или опубликовать ее в книге), со ссылкой на оригинальную публикацию в этом журнале. Авторам разрешается размещать их работу в сети Интернет (например, в университетском хранилище или на их персональном веб-сайте) до и во время процесса рассмотрения ее данным журналом, так как это может привести к продуктивному обсуждению, а также к большему количеству ссылок на данную опубликованную работу (Смотри The Effect of Open Access).